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Text File  |  1995-03-04  |  2.0 KB  |  44 lines
  1. **********************
  2. * Granins signatures *
  3. **********************
  4.  
  5. Granins (chromogranins or secretogranins) [1] are  a family of acidic proteins
  6. present in the secretory  granules of a  wide  variety of endocrine and neuro-
  7. endocrine cells. The exact function(s) of these  proteins is not yet known but
  8. they seem to be the precursors of biologically active peptides and/or they may
  9. act  as  helper   proteins  in   the   packaging  of   peptide  hormones   and
  10. neuropeptides. Three members  of this family of  proteins  show some  sequence
  11. similarities:
  12.  
  13.  - Chromogranin A (CGA) [2]. CGA is a protein of about 420 residues; it is the
  14.    precursor of the  peptide pancreastatin  which  strongly  inhibits glucose-
  15.    induced insulin release from the pancreas.
  16.  - Secretogranin 1 (chromogranin B). A sulfated protein of about 600 residues.
  17.  - Secretogranin 2 (chromogranin C). A sulfated protein of about 650 residues.
  18.  
  19. Apart from  their  subcellular  location  and the abundance of acidic residues
  20. (Asp and Glu), these proteins do not share many structural similarities.  Only
  21. one short region, located in the C-terminal section, is conserved in all these
  22. proteins.  Chromogranins A and B share a region of high similarity in their N-
  23. terminal section;  this  region  includes  two cysteine residues involved in a
  24. disulfide bond.
  25.  
  26. -Consensus pattern: [DE]-[SN]-L-[SAN]-x(2)-[DE]-x-E-L
  27. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  28.  for mouse secretogranin 2.
  29. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: 4.
  30.  
  31. -Consensus pattern: C-[LIVM](2)-E-[LIVM](2)-S-[DN]-[STA]-L-x-K-x-S-x(3)-
  32.                     [LIVM]-[STA]-x-E-C
  33.                     [The two C's are linked by a disulfide bond]
  34. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: Chromogranin
  35.  A and B.
  36. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  37.  
  38. -Last update: December 1991 / Patterns and text revised.
  39.  
  40. [ 1] Huttner W.B., Gerdes H.-H., Rosa P.
  41.      Trends Biochem. Sci. 16:27-30(1991).
  42. [ 2] Simon J.-P., Aunis D.
  43.      Biochem. J. 262:1-13(1989).
  44.